Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd40lgP27548 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd40lgP27548 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd40lgP27548 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms