Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ChgaP26339 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgaP26339 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChgaP26339 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChgaP26339 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChgaP26339 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChgaP26339 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms