Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo2P25801 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo2P25801 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo2P25801 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo2P25801 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo2P25801 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo2P25801 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmo2P25801 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmo2P25801 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmo2P25801 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmo2P25801 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmo2P25801 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lmo2P25801 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmo2P25801 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms