Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax3P24610 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pax3P24610 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pax3P24610 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pax3P24610 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax3P24610 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax3P24610 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pax3P24610 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax3P24610 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax3P24610 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pax3P24610 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax3P24610 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pax3P24610 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax3P24610 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pax3P24610 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax3P24610 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax3P24610 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax3P24610 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax3P24610 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax3P24610 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms