Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gria1P23818 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gria1P23818 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gria1P23818 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gria1P23818 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms