Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd11P23813 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms