Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata3P23772 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms