Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ggta1P23336 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ggta1P23336 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ggta1P23336 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ggta1P23336 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ggta1P23336 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ggta1P23336 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ggta1P23336 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ggta1P23336 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Ggta1P23336 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ggta1P23336 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Ggta1P23336 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms