Protein–RNA interactions for Protein: P22366

Myd88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myd88P22366 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myd88P22366 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myd88P22366 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myd88P22366 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myd88P22366 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myd88P22366 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myd88P22366 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myd88P22366 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms