Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45bP22339 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45bP22339 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms