Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnc2P20801 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc2P20801 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms