Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ms4a2P20490 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms