Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lsp1P19973 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lsp1P19973 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lsp1P19973 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lsp1P19973 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsp1P19973 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsp1P19973 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsp1P19973 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lsp1P19973 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lsp1P19973 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsp1P19973 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsp1P19973 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsp1P19973 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsp1P19973 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsp1P19973 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lsp1P19973 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lsp1P19973 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lsp1P19973 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lsp1P19973 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lsp1P19973 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lsp1P19973 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lsp1P19973 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lsp1P19973 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lsp1P19973 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsp1P19973 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms