Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a1P19437 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a1P19437 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms