Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnnc1P19123 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms