Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RargP18911 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RargP18911 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RargP18911 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RargP18911 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RargP18911 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RargP18911 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RargP18911 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RargP18911 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RargP18911 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RargP18911 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RargP18911 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RargP18911 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RargP18911 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RargP18911 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RargP18911 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RargP18911 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RargP18911 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RargP18911 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RargP18911 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RargP18911 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RargP18911 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RargP18911 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RargP18911 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RargP18911 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RargP18911 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RargP18911 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RargP18911 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RargP18911 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RargP18911 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RargP18911 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RargP18911 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RargP18911 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RargP18911 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RargP18911 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RargP18911 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RargP18911 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RargP18911 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RargP18911 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RargP18911 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RargP18911 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RargP18911 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RargP18911 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RargP18911 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RargP18911 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RargP18911 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RargP18911 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RargP18911 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RargP18911 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RargP18911 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RargP18911 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RargP18911 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RargP18911 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RargP18911 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RargP18911 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RargP18911 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RargP18911 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RargP18911 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RargP18911 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RargP18911 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RargP18911 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RargP18911 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms