Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdc1P18828 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms