Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms