Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps6ka1P18653 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka1P18653 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms