Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18529 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18529 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18529 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18529 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18529 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P18529 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P18529 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18529 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18529 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18529 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18529 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18529 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18529 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18529 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18529 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18529 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18529 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18529 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18529 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18529 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18529 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18529 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18529 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18529 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18529 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18529 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18529 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18529 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18529 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18529 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18529 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18529 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18529 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18529 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18529 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18529 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18529 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P18529 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18529 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18529 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18529 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P18529 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P18529 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P18529 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18529 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P18529 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18529 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18529 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18529 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18529 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P18529 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms