Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18528 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18528 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18528 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18528 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18528 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18528 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18528 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P18528 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P18528 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P18528 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18528 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18528 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18528 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18528 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18528 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18528 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18528 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18528 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18528 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18528 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18528 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18528 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18528 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18528 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms