Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxb1P17919 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxb1P17919 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms