Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sptan1P16546 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptan1P16546 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptan1P16546 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms