Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp53P15975 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp53P15975 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp53P15975 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp53P15975 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp53P15975 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms