Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rag1P15919 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rag1P15919 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rag1P15919 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms