Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf1P15314 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf1P15314 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf1P15314 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf1P15314 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms