Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms