Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nr4a1P12813 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nr4a1P12813 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms