Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnp2P11378 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnp2P11378 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms