Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fv4P11370 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fv4P11370 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Fv4P11370 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fv4P11370 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fv4P11370 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fv4P11370 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fv4P11370 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fv4P11370 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms