Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sub1P11031 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms