Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc6P10629 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc6P10629 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms