Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd4P10628 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd4P10628 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms