Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nid1P10493 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nid1P10493 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nid1P10493 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nid1P10493 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nid1P10493 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nid1P10493 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nid1P10493 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nid1P10493 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms