Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms