Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl2P10148 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl2P10148 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms