Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3cP0DOY1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Dnmt3cP0DOY1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms