Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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PtprqP0C5E4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PtprqP0C5E4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PtprqP0C5E4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PtprqP0C5E4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PtprqP0C5E4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PtprqP0C5E4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PtprqP0C5E4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprqP0C5E4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtprqP0C5E4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PtprqP0C5E4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PtprqP0C5E4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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PtprqP0C5E4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprqP0C5E4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms