Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb8P09632 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb8P09632 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb8P09632 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb8P09632 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb8P09632 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb8P09632 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb8P09632 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb8P09632 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb8P09632 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb8P09632 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb8P09632 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms