Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax1P09084 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax1P09084 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax1P09084 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms