Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb1P09055 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb1P09055 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb1P09055 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb1P09055 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb1P09055 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb1P09055 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb1P09055 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb1P09055 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb1P09055 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb1P09055 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb1P09055 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb1P09055 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb1P09055 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb1P09055 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb1P09055 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1P09055 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms