Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NefmP08553 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NefmP08553 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NefmP08553 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NefmP08553 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefmP08553 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NefmP08553 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NefmP08553 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NefmP08553 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NefmP08553 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NefmP08553 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NefmP08553 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NefmP08553 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NefmP08553 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NefmP08553 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NefmP08553 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NefmP08553 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NefmP08553 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NefmP08553 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NefmP08553 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NefmP08553 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NefmP08553 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NefmP08553 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NefmP08553 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NefmP08553 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NefmP08553 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NefmP08553 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NefmP08553 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NefmP08553 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NefmP08553 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NefmP08553 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NefmP08553 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NefmP08553 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NefmP08553 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NefmP08553 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NefmP08553 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NefmP08553 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NefmP08553 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NefmP08553 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NefmP08553 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NefmP08553 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NefmP08553 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NefmP08553 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NefmP08553 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NefmP08553 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NefmP08553 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NefmP08553 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NefmP08553 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NefmP08553 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NefmP08553 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NefmP08553 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NefmP08553 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NefmP08553 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NefmP08553 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NefmP08553 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NefmP08553 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NefmP08553 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NefmP08553 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NefmP08553 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NefmP08553 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NefmP08553 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NefmP08553 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NefmP08553 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NefmP08553 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NefmP08553 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NefmP08553 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NefmP08553 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NefmP08553 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NefmP08553 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NefmP08553 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NefmP08553 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms