Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtrP07309 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TtrP07309 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtrP07309 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtrP07309 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TtrP07309 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtrP07309 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtrP07309 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtrP07309 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtrP07309 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtrP07309 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtrP07309 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtrP07309 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtrP07309 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtrP07309 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtrP07309 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtrP07309 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtrP07309 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtrP07309 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtrP07309 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TtrP07309 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtrP07309 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtrP07309 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtrP07309 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtrP07309 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtrP07309 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtrP07309 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtrP07309 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtrP07309 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtrP07309 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TtrP07309 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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