Protein–RNA interactions for Protein: P06684

C5, Complement C5, mousemouse

Predictions only

Length 1,680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5P06684 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C5P06684 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C5P06684 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C5P06684 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C5P06684 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
C5P06684 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C5P06684 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C5P06684 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C5P06684 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C5P06684 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C5P06684 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C5P06684 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C5P06684 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
C5P06684 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C5P06684 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C5P06684 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C5P06684 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C5P06684 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C5P06684 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C5P06684 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C5P06684 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C5P06684 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C5P06684 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5P06684 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5P06684 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5P06684 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5P06684 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5P06684 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5P06684 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5P06684 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5P06684 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5P06684 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C5P06684 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C5P06684 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C5P06684 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C5P06684 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C5P06684 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C5P06684 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C5P06684 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C5P06684 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C5P06684 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C5P06684 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C5P06684 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C5P06684 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C5P06684 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5P06684 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5P06684 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5P06684 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5P06684 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C5P06684 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5P06684 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C5P06684 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C5P06684 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C5P06684 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C5P06684 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C5P06684 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C5P06684 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C5P06684 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C5P06684 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C5P06684 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5P06684 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C5P06684 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C5P06684 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5P06684 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5P06684 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5P06684 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5P06684 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5P06684 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5P06684 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5P06684 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5P06684 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5P06684 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5P06684 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5P06684 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5P06684 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5P06684 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C5P06684 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C5P06684 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C5P06684 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms