Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06335 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06335 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06335 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06335 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06335 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06335 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06335 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06335 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06335 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06335 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06335 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P06335 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06335 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06335 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06335 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06335 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P06335 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P06335 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P06335 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms