Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06323 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06323 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06323 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06323 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06323 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06323 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P06323 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06323 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06323 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06323 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06323 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06323 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06323 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06323 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P06323 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06323 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06323 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06323 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06323 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06323 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06323 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms