Protein–RNA interactions for Protein: P02716

Chrnd, Acetylcholine receptor subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrndP02716 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChrndP02716 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChrndP02716 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms