Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-AaP01910 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms