Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B2mP01887 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B2mP01887 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B2mP01887 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B2mP01887 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B2mP01887 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B2mP01887 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B2mP01887 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B2mP01887 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B2mP01887 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B2mP01887 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B2mP01887 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B2mP01887 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms