Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01728 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01728 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01728 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01728 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01728 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01728 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01728 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01728 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01728 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01728 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01728 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01728 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01728 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01728 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01728 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01728 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01728 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01728 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01728 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01728 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01728 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01728 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01728 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01728 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01728 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01728 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01728 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01728 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01728 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01728 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms